RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SMCO2A6NFE2 343 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ATP8B1O43520 1251 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 TAF12Q16514 161 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 TPH2Q8IWU9 490 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ATP2A3Q93084 1043 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 KCNQ2O43526 872 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 SSH2Q76I76 1423 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 SUN1O94901 812 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ABCC4O15439 1325 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB7AO95365 584 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 GNA14O95837 355 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 SLC8A3P57103 927 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRMP28827 1452 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 TNNI1P19237 187 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 MX2P20592 715 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PPARAQ07869 468 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PPP2R5BQ15173 497 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 HOOK2Q96ED9 719 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PPP2R5AQ15172 486 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 CFBP00751 764 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 SLC1A4P43007 532 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 RCN2Q14257 317 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 MORC4Q8TE76 937 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 H2AFZP0C0S5 128 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 APBA1Q02410 837 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 H2AFVQ71UI9 128 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 PHBP35232 272 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 CPXCR1Q8N123 301 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ZMYM6O95789 1325 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 IRX4P78413 519 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 KAZNQ674X7 775 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 BLIDQ8IZY5 108 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ST7Q9NRC1 585 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 RAB20Q9NX57 234 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ATF2P15336 505 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 WDR70Q9NW82 654 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 CEP152O94986 1710 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRU-204ENST00000428026 EPHB4P54760 987 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 ARID5BQ14865 1188 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 CXorf38Q8TB03 319 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 ATG3Q9NT62 314 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 SLC12A2P55011 1212 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 NNTQ13423 1086 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 LLGL1Q15334 1064 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 WHAMMQ8TF30 809 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 EXOC4Q96A65 974 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 RPS6KA2Q15349 733 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 NLRP10Q86W26 655 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 ABCB6Q9NP58 842 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 ADCY9O60503 1353 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 DBN1Q16643 649 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 SSH3Q8TE77 659 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 KLHL29Q96CT2 875 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 PANK4Q9NVE7 773 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRU-204ENST00000428026 SLCO1A2P46721 670 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms