RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 CD4P01730 458 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 PTGS1P23219 599 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 EDNRBP24530 442 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 TTC22Q5TAA0 569 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 MFSD5Q6N075 450 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 KAT14Q9H8E8 782 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 ZEB2O60315 1214 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 RGS22Q8NE09 1264 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 DNERQ8NFT8 737 aa24.4■■□□□ 1.5
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UBXN4-204ENST00000426921 KRT23Q9C075 422 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 CDH23Q9H251 3354 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 TNKSO95271 1327 aa24.39■■□□□ 1.5
UBXN4-204ENST00000426921 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 CALML3P27482 149 aa24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 CPVLQ9H3G5 476 aa24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 GRIN2DO15399 1336 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 ITGA7Q13683 1181 aa24.37■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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UBXN4-204ENST00000426921 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.491e-13■□□□□ 10.1
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UBXN4-204ENST00000426921 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 ABCB11O95342 1321 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 PDE4DQ08499 809 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM199Q8N511 208 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 FAM161BQ96MY7 647 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.491e-6■□□□□ 9.8
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UBXN4-204ENST00000426921 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 A0A0C4DFX4 3053 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
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UBXN4-204ENST00000426921 SEC23AQ15436 765 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 RASIP1Q5U651 963 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 SCFD2Q8WU76 684 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.34■■□□□ 1.49
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UBXN4-204ENST00000426921 B4DLN1 442 aa24.33■■□□□ 1.49
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UBXN4-204ENST00000426921 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 PPP2R5BQ15173 497 aa24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM240Q5SV17 173 aa24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-204ENST00000426921 B4GALT4O60513 344 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 CHMLP26374 656 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 PSMC6P62333 389 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.32■■□□□ 1.48
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UBXN4-204ENST00000426921 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
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UBXN4-204ENST00000426921 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.31■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.31■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
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UBXN4-204ENST00000426921 HIPK3Q9H422 1215 aa24.31■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.31■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 A6NJR5 290 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 CYP21A2P08686 494 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 GHRHRQ02643 423 aa24.3■■□□□ 1.48
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UBXN4-204ENST00000426921 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D5Q92609 795 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 MTMR8Q96EF0 704 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 IL23AQ9NPF7 189 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 COL20A1Q9P218 1284 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 EYSQ5T1H1 3165 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-204ENST00000426921 PTH1RQ03431 593 aa24.29■■□□□ 1.48
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