RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPY3P0CV98 308 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPY8P0CW00 308 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1328Q86T90 577 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCG1P19174 1290 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 DNM2P50570 870 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC15A2Q16348 729 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 GBP3Q9H0R5 595 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 STXBP3O00186 592 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD14O00487 310 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 BTDP43251 543 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN26Q16670 478 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC102AQ96A19 550 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC1Q9NV70 894 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 BARHL2Q9NY43 387 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAQP50148 359 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PHACTR2O75167 634 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE4DQ08499 809 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PICALMQ13492 652 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CABP7Q86V35 215 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MMS19Q96T76 1030 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 LETM2Q2VYF4 491 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 RCCD1A6NED2 376 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL1P05976 194 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT83P78385 493 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CERS5Q8N5B7 392 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 NPR1P16066 1061 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 STK4Q13043 487 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF10A6NK89 507 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 FCER1AP12319 257 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ASIC1P78348 528 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKS1AQ92625 1134 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RX5Q93086 422 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 FLT1P17948 1338 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 G3V3G9 751 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT86O43790 486 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 NAPAP54920 295 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MEA1Q16626 185 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM9Q9C026 710 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 SLX4Q8IY92 1834 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNE1P24864 410 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP27A1Q02318 531 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR93Q6P2C0 686 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 SP8Q8IXZ3 490 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 HPS3Q969F9 1004 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRF2D3W0D1 207 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 LAD1O00515 517 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBBP07437 444 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52Z1P0C646 297 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 USP14P54578 494 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 GALNT17Q6IS24 598 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPHP41219 470 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms