RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 CTSHP09668 335 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 NPR1P16066 1061 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 MAOBP27338 520 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 RBL2Q08999 1139 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 MAP7Q14244 749 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 CBLL1Q75N03 491 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 CCNJLQ8IV13 435 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 GCC1Q96CN9 775 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRK-210ENST00000415055 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 LGR6Q9HBX8 967 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 CAPN10Q9HC96 672 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PP55 124 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 FAM170BA6NMN3 283 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-210ENST00000415055 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 DPH6Q7L8W6 267 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 GATA6Q92908 595 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 BCO2Q9BYV7 579 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 EHD4Q9H223 541 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 BCORQ6W2J9 1755 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 NFICP08651 508 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 RAB6AP20340 208 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 GRIA4P48058 902 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 HUNKP57058 714 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 CYP27A1Q02318 531 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 NOGQ13253 232 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 PWP1Q13610 501 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 GRM2Q14416 872 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 DYMQ7RTS9 669 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 USP48Q86UV5 1035 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 NIM1KQ8IY84 436 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 TCF12Q99081 682 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 RAD18Q9NS91 495 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0C4DFX4 3053 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 A1BGP04217 495 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 CTSBP07858 339 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-210ENST00000415055 ALDH1B1P30837 517 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 GJA8P48165 433 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 FLCNQ8NFG4 579 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 ASIC4Q96FT7 647 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 CORO1BQ9BR76 489 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 GGT7Q9UJ14 662 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-210ENST00000415055 PPIP5K2O43314 1243 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 CAMTA2O94983 1202 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 B3GALT4O96024 378 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 HMOX1P09601 288 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 GSTT1P30711 240 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 TEFQ10587 303 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 FZD5Q13467 585 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 PSMD1Q99460 953 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-210ENST00000415055 COL4A5P29400 1685 aa6.01□□□□□ -1.45
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