RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LPIN3Q9BQK8 851 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LGR4Q9BXB1 951 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNF38Q9H0F5 515 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CHST12Q9NRB3 414 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNH3Q9ULD8 1083 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CEP131Q9UPN4 1083 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DMTF1Q9Y222 760 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LZTS1Q9Y250 596 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FHOD1Q9Y613 1164 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC35F4A4IF30 521 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NEURL1BA8MQ27 555 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CBX4O00257 560 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MEIS1O00470 390 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SART1O43290 800 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TBX1O43435 398 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC26A4O43511 780 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DTNBO60941 627 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HIP1RO75146 1068 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VAMP4O75379 141 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RGS20O76081 388 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 APBA3O96018 575 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CST3P01034 146 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SETSIPP0DME0 302 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LSP1P33241 339 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CD68P34810 354 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GRIK1P39086 918 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HALP42357 657 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CASP2P42575 452 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAP2K3P46734 347 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCT5P48643 541 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 USP11P51784 963 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPR85P60893 370 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BTKQ06187 659 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCDC157Q569K6 752 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IFFO2Q5TF58 517 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STYK1Q6J9G0 422 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FDX2Q6P4F2 183 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC5A5Q92911 643 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KIFC2Q96AC6 838 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KLHDC7BQ96G42 594 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SCLYQ96I15 445 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KREMEN1Q96MU8 473 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AIFM3Q96NN9 605 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WDR18Q9BV38 432 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PHF20Q9BVI0 1012 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 YIPF2Q9BWQ6 316 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ASPNQ9BXN1 380 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SENP2Q9HC62 589 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EMC7Q9NPA0 242 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CASS4Q9NQ75 786 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WDR64B1ANS9 1081 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CBFA2T2O43439 604 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MGEA5O60502 916 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CD3EP07766 207 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AMPD1P23109 780 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LTBRP36941 435 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms