RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409766.7

USP39-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP39, Length 2,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-204ENST00000409766 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.64■■□□□ 1.21
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USP39-204ENST00000409766 GH2P01242 217 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP39-204ENST00000409766 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP39-204ENST00000409766 HAS1Q92839 578 aa22.6■■□□□ 1.21
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USP39-204ENST00000409766 KCNJ12Q14500 433 aa22.58■■□□□ 1.2
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USP39-204ENST00000409766 CNTNAP1P78357 1384 aa22.58■■□□□ 1.2
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USP39-204ENST00000409766 SV2BQ7L1I2 683 aa22.57■■□□□ 1.2
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USP39-204ENST00000409766 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 KRT79Q5XKE5 535 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 PANX2Q96RD6 677 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 ANO3Q9BYT9 981 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP39-204ENST00000409766 N4BP3O15049 544 aa22.56■■□□□ 1.2
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