RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379359.3

RGCC-201, Transcript of regulator of cell cycle, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RGCC, Length 960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCC-201ENST00000379359 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.34■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 ELP1O95163 1332 aa23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 E7EWF7 191 aa23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 FBXO11Q86XK2 927 aa23.33■■□□□ 1.33
RGCC-201ENST00000379359 WTAPQ15007 396 aa23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 SEC23AQ15436 765 aa23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 DNERQ8NFT8 737 aa23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 MORC4Q8TE76 937 aa23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 SZT2Q5T011 3432 aa23.32■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 KLRF2D3W0D1 207 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CHST3Q7LGC8 479 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 MAP4K1Q92918 833 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 TOX2Q96NM4 488 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.31■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 LAMA3Q16787 3333 aa23.3■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 PTGS1P23219 599 aa23.3■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.3■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 RGS22Q8NE09 1264 aa23.3■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 Q9Y3F1 56 aa23.3■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.3■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 ARVCFO00192 962 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 KIAA0355O15063 1070 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CTAGE5O15320 804 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CABYRO75952 493 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 FAAP100Q0VG06 881 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 AMNQ9BXJ7 453 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.29■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 LCTP09848 1927 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 NKX3-2P78367 333 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 PPP2R5BQ15173 497 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CASC1Q6TDU7 716 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 HOMER1Q86YM7 354 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 LTBP2Q14767 1821 aa23.28■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 CFBP00751 764 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 FPGSQ05932 587 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 GRM4Q14833 912 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 SHHQ15465 462 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 SCFD2Q8WU76 684 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 TBC1D5Q92609 795 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 MAF1Q9H063 256 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RGCC-201ENST00000379359 ZBTB5O15062 677 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 ITGB8P26012 769 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 CPT1AP50416 773 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 CDK7P50613 346 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 GPR153Q6NV75 609 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 SKAP1Q86WV1 359 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 DEFB123Q8N688 67 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 SENP2Q9HC62 589 aa23.26■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 MYL3P08590 195 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 EDNRBP24530 442 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 TRAF1Q13077 416 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 ITGA7Q13683 1181 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 RMDN3Q96TC7 470 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.25■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 TIMP1P01033 207 aa23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 PSMC6P62333 389 aa23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 TTLL4Q14679 1199 aa23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 Q7L0L9 218 aa23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.24■■□□□ 1.31
RGCC-201ENST00000379359 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms