RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRT1-202ENST00000375150 RNF146Q9NTX7 359 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRT1-202ENST00000375150 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.58■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 NFIBO00712 420 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 BMP15O95972 392 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 NEK8Q86SG6 692 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 TBCKQ8TEA7 893 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 ANO3Q9BYT9 981 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 BTBD7Q9P203 1132 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 HSD17B4P51659 736 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 GHRHRQ02643 423 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 NBR1Q14596 966 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 ACAD9Q9H845 621 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 RIPK3Q9Y572 518 aa21.56■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 COPB2P35606 906 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 INHBEP58166 350 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 SLC39A14Q15043 492 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 JMYQ8N9B5 988 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PGBD1Q96JS3 809 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 MAF1Q9H063 256 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 SPTLC2O15270 562 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 CYP2C8P10632 490 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 CHST13Q8NET6 341 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PTPN18Q99952 460 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 FBXO40Q9UH90 709 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 SREBF2Q12772 1141 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PTPAQ15257 358 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 LETM2Q2VYF4 491 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 TBC1D5Q92609 795 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 CREBZFQ9NS37 354 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 CNMDO75829 334 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 SLC25A27O95847 323 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 ME1P48163 572 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 APLP1P51693 650 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF174Q15697 407 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 NSMFQ6X4W1 530 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 MCM7P33993 719 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 SREBF1P36956 1147 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 UBE2HP62256 183 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-202ENST00000375150 WNT7AO00755 349 aa21.52■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 PPP6R2O75170 966 aa21.52■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 USP11P51784 963 aa21.52■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.52■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 ERVK-9P63128 1117 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 ERVK-24P63145 666 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGAP4P98171 946 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 PEX10O60683 326 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 CCNA1P78396 465 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 RASSF10A6NK89 507 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 LAD1O00515 517 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 NEMFO60524 1076 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 GRM1Q13255 1194 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 PTGDRQ13258 359 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 IFNL1Q8IU54 200 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-202ENST00000375150 PFASO15067 1338 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms