RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CPS1P31327 1500 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RPS6KA4O75676 772 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM58Q8NG06 486 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 STMN2Q93045 179 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ALAS1P13196 640 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PEX26Q7Z412 305 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PPFIA4O75335 1185 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 STAT1P42224 750 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 IWS1Q96ST2 819 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 VCX3BQ9H321 246 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CHUKO15111 745 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CDC25AP30304 524 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TBCKQ8TEA7 893 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CASP14P31944 242 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 BAG6P46379 1132 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CYP2J2P51589 502 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TRPC3Q13507 836 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CYP4A11Q02928 519 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 DGKHQ86XP1 1220 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PIGSQ96S52 555 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 LIN9Q5TKA1 542 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 COBLO75128 1261 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ADAM9Q13443 819 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 AZI2Q9H6S1 392 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 USP17L3A6NCW0 530 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 USP17L4A6NCW7 530 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CCT5P48643 541 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GNGT1P63211 74 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ABCC12Q96J65 1359 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PGBD1Q96JS3 809 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 NT5C2P49902 561 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KCTD1Q719H9 257 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 LRRC45Q96CN5 670 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CSRNP1Q96S65 589 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 HIP1RO75146 1068 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PRDX5P30044 214 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 EPSTI1Q96J88 318 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 NARFQ9UHQ1 456 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 NEDD4P46934 1319 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PAK2Q13177 524 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms