RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYTL1Q9NRR1 136 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MCM8Q9UJA3 840 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TNRQ92752 1358 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A8MWP4 228 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF878C9JN71 531 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 M0R082 166 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NOBOXO60393 691 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PEX10O60683 326 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MOSPD3O75425 235 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ALX3O95076 343 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT6AP02538 564 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT6BP04259 564 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 F13BP05160 661 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM90A13PP0C7W8 464 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM90A24PP0C7X0 464 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARAFP10398 606 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT6CP48668 564 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PXNP49023 591 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DLX5P56178 289 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GJA9P57773 515 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR2DS5Q14953 304 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ETFDHQ16134 617 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC6Q16204 474 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAPKAPK3Q16644 382 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C4orf17Q53FE4 359 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RASIP1Q5U651 963 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL17RELQ6ZVW7 336 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYFIP1Q7L576 1253 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLNKQ7Z7G1 428 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLEC10AQ8IUN9 316 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF280CQ8ND82 737 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF417Q8TAU3 575 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM174AQ8TBP5 190 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C7orf43Q8WVR3 580 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EXTL1Q92935 676 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF31Q96EP0 1072 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DDX11Q96FC9 970 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MISP3Q96FF7 219 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1orf159Q96HA4 380 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FGD4Q96M96 766 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR25Q96S07 402 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPATA25Q9BR10 227 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CFHR5Q9BXR6 569 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BTBD1Q9H0C5 482 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNRKQ9NRH2 765 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PHF24Q9UPV7 400 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MXRA5Q9NR99 2828 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHD8Q9HCK8 2581 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0B4J293 547 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VEGFDO43915 354 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLB1P16278 677 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPR3P17342 541 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPTP24298 496 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIK3CGP48736 1102 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIM32Q13049 653 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SF1Q15637 639 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LDLRAD1Q5T700 205 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPINK6Q6UWN8 80 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEFF1Q8IYR6 380 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AMER3Q8N944 861 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HMCESQ96FZ2 354 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COQ10AQ96MF6 247 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PWWP2AQ96N64 755 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRDM7Q9NQW5 492 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF19AQ9NV58 838 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM39AQ9NV64 488 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANAPC11Q9NYG5 84 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF180Q9UJW8 692 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR23AA6NEV1 266 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR32B1ATL7 298 aa-1.55□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms