RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364207.1

RNU6-188P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 188, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-188P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-188P-201ENST00000364207 PLS3P13797 630 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GABREP78334 506 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZPBP2Q6X784 338 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 USP53Q70EK8 1073 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PTPRN2Q92932 1015 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLC6A17Q9H1V8 727 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GPR27Q9NS67 375 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TMEM260Q9NX78 707 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 CLEC1BQ9P126 229 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GPR160Q9UJ42 338 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 DLX3O60479 287 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PNLIPP16233 465 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TCEA2Q15560 299 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 KCNMB1Q16558 191 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 LILRB2Q8N423 598 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 NUP43Q8NFH3 380 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 FRS2Q8WU20 508 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 OSBP2Q969R2 916 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ASIC4Q96FT7 647 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 LGR4Q9BXB1 951 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TMX1Q9H3N1 280 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ENPP3O14638 875 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PLD2O14939 933 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 CDC45O75419 566 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GLI1P08151 1106 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 CANXP27824 592 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GRIA2P42262 883 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 CYP4F8P98187 520 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 KIZQ2M2Z5 673 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 STYK1Q6J9G0 422 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 CPNE8Q86YQ8 564 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TMEM52Q8NDY8 209 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PANK1Q8TE04 598 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 USP33Q8TEY7 942 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 C1orf159Q96HA4 380 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 JMJD8Q96S16 334 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 C7orf72A4D263 438 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 H7BY64 318 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ABLIM1O14639 778 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PRKCAP17252 672 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 HSD3B2P26439 372 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GPR85P60893 370 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 LSAMPQ13449 338 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 NR1I3Q14994 352 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 FAM209AQ5JX71 171 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 SDE2Q6IQ49 451 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 NLRX1Q86UT6 975 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 LZTR1Q8N653 840 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 EXOC2Q96KP1 924 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ALG1Q9BT22 464 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 TBX22Q9Y458 520 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 OR14I1A6ND48 311 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 GSTA4O15217 222 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 PSPNO60542 156 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 MAFKO60675 156 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 MPOP05164 745 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 ITGB5P18084 799 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 CHRNA2Q15822 529 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-188P-201ENST00000364207 MROH9Q5TGP6 573 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms