RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359175.8

SPTSSB-201, Transcript of serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTSSB, Length 3,103 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSB-201ENST00000359175 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 NELFBQ8WX92 580 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ESYT3A0FGR9 886 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 BTBD11A6QL63 1104 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ZNF263O14978 683 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 IMPDH2P12268 514 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CXCR5P32302 372 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 SPA17Q15506 151 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC96Q2M329 555 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC38Q502W7 563 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 WASF1Q92558 559 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 NEO1Q92859 1461 aa14.7□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 RNF8O76064 485 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ZBED6P86452 979 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 GCKRQ14397 625 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CENPTQ96BT3 561 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 MOCS3O95396 460 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 EPSTI1Q96J88 318 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 RXRAP19793 462 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 HSD17B3P37058 310 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 DNM2P50570 870 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ZNF844Q08AG5 666 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 TSKSQ9UJT2 592 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ABLIM1O14639 778 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ZNF213O14771 459 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ASAP2O43150 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 TLR10Q9BXR5 811 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 MYH10P35580 1976 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 BACH1O14867 736 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 SRGNP10124 158 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 SEPT2Q15019 361 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 GNPTABQ3T906 1256 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ODF2Q5BJF6 829 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ATL2Q8NHH9 583 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 TBC1D5Q92609 795 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 PSMB7Q99436 277 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 EID1Q9Y6B2 187 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ABCC12Q96J65 1359 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ZBTB43O43298 467 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC42Q96M95 316 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 SMIM24O75264 130 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 HOXC9P31274 260 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 HHATQ5VTY9 493 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 MICU3Q86XE3 530 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 LRRC45Q96CN5 670 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 GPR108Q9NPR9 543 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.67□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 RASSF10A6NK89 507 aa14.66□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 LCA5LO95447 670 aa14.66□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.66□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.66□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 XDHP47989 1333 aa14.66□□□□□ -0.06
SPTSSB-201ENST00000359175 AFF2P51816 1311 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms