RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 NR1H3Q13133 447 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PTK2Q05397 1052 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PRR16Q569H4 304 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 IL9RQ01113 521 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PHKBQ93100 1093 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MTA3Q9BTC8 594 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PANK4Q9NVE7 773 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MTX1Q13505 466 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 KLRF2D3W0D1 207 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 WHAMMQ8TF30 809 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 EPHB4P54760 987 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FAM227BQ96M60 508 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TIMM10P62072 90 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SLMAPQ14BN4 828 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MUM1Q2TAK8 710 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ODR4Q5SWX8 454 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB9Q96C00 473 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 USP40Q9NVE5 1235 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 USP6P35125 1406 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SUN1O94901 812 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3CAP42336 1068 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MYL7Q01449 175 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 H2AFZP0C0S5 128 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CUL1Q13616 776 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 H2AFVQ71UI9 128 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SULF1Q8IWU6 871 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 RILPQ96NA2 401 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC63Q05C16 580 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 XKR9Q5GH70 373 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GBP5Q96PP8 586 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 STAP2Q9UGK3 403 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PRDM1O75626 825 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ADAM9Q13443 819 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 BEND3Q5T5X7 828 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 METTL13Q8N6R0 699 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MXD3Q9BW11 206 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PNMA3Q9UL41 463 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TTC4O95801 387 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO11Q86XK2 927 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ERVK-7P63135 1459 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MCF2LO15068 1137 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GSTA1P08263 222 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GSTA2P09210 222 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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