RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 WNT7AO00755 349 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USH1GQ495M9 461 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ADALQ6DHV7 355 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCDC174Q6PII3 467 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TMEM260Q9NX78 707 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 LIG1P18858 919 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K11Q16584 847 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZNF280DQ6N043 979 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 JMYQ8N9B5 988 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 C12orf42Q96LP6 360 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 HMGCS2P54868 508 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CBX1P83916 185 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZNF174Q15697 407 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 UBE2SQ16763 222 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 INF2Q27J81 1249 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ELP3Q9H9T3 547 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RLFQ13129 1914 aa6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQ27 194 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQ64 194 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQD8 194 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 BMP15O95972 392 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TRAF1Q13077 416 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MOB2Q70IA6 237 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CUTAO60888 179 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SCP2P22307 547 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TRAF5O00463 557 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FLOT1O75955 427 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MCM7P33993 719 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PPATQ06203 517 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 LDHDQ86WU2 507 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FSIP1Q8NA03 581 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 YY1AP1Q9H869 796 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ABCB11O95342 1321 aa6.86□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NR1I2O75469 434 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCDC172P0C7W6 258 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TBCKQ8TEA7 893 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CLIC6Q96NY7 704 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZNF536O15090 1300 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L15C9J2P7 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L11C9JVI0 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L18D6R9N7 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L22D6RA61 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L19D6RCP7 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L20D6RJB6 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 OPLAHO14841 1288 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ICAM1P05362 532 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PTPREP23469 700 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CMA1P23946 247 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L24Q0WX57 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PTGDRQ13258 359 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RESP18Q5W5W9 173 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NEK8Q86SG6 692 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ERO1BQ86YB8 467 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 DACT1Q9NYF0 836 aa6.85□□□□□ -1.31
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