RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC41Q15345 812 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN21Q16825 1174 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 RASSF7Q02833 373 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 TFDP1Q14186 410 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 POTEDQ86YR6 584 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 AMNQ9BXJ7 453 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 EFCC1Q9HA90 598 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 RNF40O75150 1001 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ATP1A2P50993 1020 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MYOM2P54296 1465 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MEIS1O00470 390 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINB2P05120 415 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 MAP7Q14244 749 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL1O95922 423 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 OSBPP22059 807 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 MESDQ14696 234 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SSH2Q76I76 1423 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ABI1Q8IZP0 508 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SMYD2Q9NRG4 433 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 UBE3CQ15386 1083 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PRKAB2O43741 272 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA1Q5VX52 437 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 RNF8O76064 485 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 RAD17O75943 681 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ARPP19P56211 112 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 GNGT1P63211 74 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PIGSQ96S52 555 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC68Q9H2F9 335 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA3EO15041 775 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A1P02730 911 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 MFAP3P55082 362 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ESYT2A0FGR8 921 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 CLIC2O15247 247 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB33Q86T24 672 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ECE1P42892 770 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SNAP25P60880 206 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 EHHADHQ08426 723 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 A6NNZ2 444 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SGK1O00141 431 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 H2AFZP0C0S5 128 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 H2AFVQ71UI9 128 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 RSPH3Q86UC2 560 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 COA7Q96BR5 231 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PTK2Q05397 1052 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms