RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 ABCB11O95342 1321 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 TULP2O00295 520 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 FAM71BQ8TC56 605 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 MED4Q9NPJ6 270 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 ZPR1O75312 459 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 LETM2Q2VYF4 491 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 SMCO2A6NFE2 343 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 CENPPQ6IPU0 288 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 ENC1O14682 589 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 KCNQ4P56696 695 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 GRAPQ13588 217 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 GRIK5Q16478 980 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 MMS19Q96T76 1030 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 STK17AQ9UEE5 414 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 RCCD1A6NED2 376 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 VAV2P52735 878 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 GYS2P54840 703 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 MAP9Q49MG5 647 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM5Q71RC9 77 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 EYA3Q99504 573 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 VPS18Q9P253 973 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 CDK8P49336 464 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 KLK7P49862 253 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 CALML4Q96GE6 196 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 FCER1AP12319 257 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN26Q16670 478 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXD1-201ENST00000331462 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 LMAN1P49257 510 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SOGA3Q5TF21 947 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR9Q96QG7 549 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 GNPATO15228 680 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 RPS6KA5O75582 802 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 TBCKQ8TEA7 893 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 TFR2Q9UP52 801 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 NHSQ6T4R5 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 LCA5LO95447 670 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ACTN2P35609 894 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 TECP42680 631 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 GRB10Q13322 594 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 UNC13DQ70J99 1090 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PLCG2P16885 1265 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 KIF5AQ12840 1032 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SV2BQ7L1I2 683 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CPVLQ9H3G5 476 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR7Q9Y216 660 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 BTDP43251 543 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ITIH3Q06033 890 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 VWA3BQ502W6 1294 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 IQCEQ6IPM2 695 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 POTEDQ86YR6 584 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 BTAF1O14981 1849 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF263O14978 683 aa25.11■■□□□ 1.61
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