RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 IQUBQ8NA54 791 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIFC2Q96AC6 838 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 FEZ1Q99689 392 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC37A4O43826 429 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 MTMR9Q96QG7 549 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 GGA3Q9NZ52 723 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLA2G6O60733 806 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 BMP6P22004 513 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 SPATA20Q8TB22 786 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 SMARCE1Q969G3 411 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 GINM1Q9NU53 330 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 RNF181Q9P0P0 153 aa22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 TXLNAP40222 546 aa22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 DCAF15Q66K64 600 aa22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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RIPPLY3-201ENST00000329553 OPLAHO14841 1288 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 TECP42680 631 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 FEM1BQ9UK73 627 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CASP1P29466 404 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 UBA7P41226 1012 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CALCRLQ16602 461 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM160B2Q86V87 743 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 STAMQ92783 540 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 ANO3Q9BYT9 981 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 FZD1Q9UP38 647 aa22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 TXKP42681 527 aa22.89■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC174Q6PII3 467 aa22.89■■□□□ 1.26
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RIPPLY3-201ENST00000329553 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.89■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDC25BP30305 580 aa22.89■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 SARM1Q6SZW1 724 aa22.89■■□□□ 1.25
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RIPPLY3-201ENST00000329553 MTRQ99707 1265 aa22.89■■□□□ 1.25
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RIPPLY3-201ENST00000329553 AP3B2Q13367 1082 aa22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 DGKZQ13574 1117 aa22.88■■□□□ 1.25
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RIPPLY3-201ENST00000329553 SMC2O95347 1197 aa22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 STAT6P42226 847 aa22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 WRNIP1Q96S55 665 aa22.87■■□□□ 1.25
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RIPPLY3-201ENST00000329553 USP11P51784 963 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 NCAPHQ15003 741 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 CABP7Q86V35 215 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 LPAR1Q92633 364 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLIN2Q99541 437 aa22.86■■□□□ 1.25
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RIPPLY3-201ENST00000329553 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 MCTP2Q6DN12 878 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 DRC7Q8IY82 874 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
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RIPPLY3-201ENST00000329553 TBC1D5Q92609 795 aa22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 HAS1Q92839 578 aa22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 SPP2Q13103 211 aa22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 LRRC15Q8TF66 581 aa22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 PIK3CDO00329 1044 aa22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARHGAP4P98171 946 aa22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY3-201ENST00000329553 LRMPQ12912 555 aa22.84■■□□□ 1.25
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