RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324685.10

RNF40-201, Transcript of ring finger protein 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF40, Length 5,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40-201ENST00000324685 TRAPPC10P48553 1259 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 INHBAP08476 426 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 EPHB4P54760 987 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 RASSF7Q02833 373 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 BTBD18B2RXH4 712 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PTGDRQ13258 359 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 RETREG2Q8NC44 543 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 H7C0C1 242 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SMIM24O75264 130 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ATP5OP48047 213 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 EHHADHQ08426 723 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CLTAP09496 248 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SESN3P58005 492 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 STK17AQ9UEE5 414 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CASP14P31944 242 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PRKG1Q13976 671 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PTPROQ16827 1216 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 KAZNQ674X7 775 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ECE1P42892 770 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 HDAC11Q96DB2 347 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FAM170AA1A519 330 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PPIP5K2O43314 1243 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CSADQ9Y600 493 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 USP44Q9H0E7 712 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PALD1Q9ULE6 856 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 GAP43P17677 238 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 UBE3CQ15386 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 RFX6Q8HWS3 928 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FAM81BQ96LP2 452 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 AK8Q96MA6 479 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 NT5C1BQ96P26 610 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 IKBKBO14920 756 aa22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FGAP02671 866 aa22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 GPC4O75487 556 aa22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SCRN1Q12765 414 aa22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 TFDP1Q14186 410 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SLC35F6Q8N357 371 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 MYO1FO00160 1098 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ICA1Q05084 483 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SLC39A14Q15043 492 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ABCC12Q96J65 1359 aa22.9■■□□□ 1.26
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RNF40-201ENST00000324685 BTDP43251 543 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 DCAF15Q66K64 600 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 LRRD1A4D1F6 860 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CCT5P48643 541 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 ERBB4Q15303 1308 aa22.9■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 SGK1O00141 431 aa22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 TMOD1P28289 359 aa22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
RNF40-201ENST00000324685 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
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