RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPAQ15257 358 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 FSIP1Q8NA03 581 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.566e-7■□□□□ 11
RABGGTB-201ENST00000319942 GMCL1Q96IK5 515 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 GOPCQ9HD26 462 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 HACL1Q9UJ83 578 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 STXBP3O00186 592 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB5O15062 677 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 BMP3P12645 472 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAF1Q13077 416 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K11Q16584 847 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF15Q66K64 600 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 BRICD5Q6PL45 260 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD1Q719H9 257 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 RDH13Q8NBN7 331 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SDF4Q9BRK5 362 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPY26PQ9H489 355 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 MYH1P12882 1939 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMB1P07942 1786 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ESYT2A0FGR8 921 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 NPY5RQ15761 445 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC38Q5R3I4 469 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF7Q92985 503 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF25Q93038 417 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 FERMT2Q96AC1 680 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CPVLQ9H3G5 476 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TMX2Q9Y320 296 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM232C9JQI7 657 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFB10O96000 172 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 EGFRP00533 1210 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC192P0DO97 292 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 LORP23490 312 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMK4Q16566 473 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 HPS1Q92902 700 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SHISA4Q96DD7 197 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 TEPSINQ96N21 525 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF181Q9P0P0 153 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GVL5 298 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 USP17L10C9JJH3 530 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF202O95125 648 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A2P36021 539 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 GMPRP36959 345 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 JAG1P78504 1218 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF174Q15697 407 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 MTMR8Q96EF0 704 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-201ENST00000319942 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRG0 241 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms