RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 DNM2P50570 870 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 GTF2IP78347 998 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EHHADHQ08426 723 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MIIPQ5JXC2 388 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 STK17AQ9UEE5 414 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CDC23Q9UJX2 597 aa15.46■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 BICDL2A1A5D9 508 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF543Q08ER8 600 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM47Q96LD4 638 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SLC37A4O43826 429 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PDIA5Q14554 519 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FIGNQ5HY92 759 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TTLL1O95922 423 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ADCY7P51828 1080 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 AMPD2Q01433 879 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PDE4DQ08499 809 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CENPPQ6IPU0 288 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CHP1Q99653 195 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 C6orf229H3BNL8 230 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFA10O95299 355 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FCER1AP12319 257 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 AMPD3Q01432 767 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RETREG2Q8NC44 543 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 GOLGA1Q92805 767 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EHD4Q9H223 541 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EXOC1Q9NV70 894 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ABCB11O95342 1321 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PLA2G4AP47712 749 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SLC35F6Q8N357 371 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CALCRLQ16602 461 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PROM2Q8N271 834 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 COA7Q96BR5 231 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1W2PQJ5 194 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TDP2O95551 362 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ASIC1P78348 528 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 UNC13DQ70J99 1090 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CALML4Q96GE6 196 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 NUP58Q9BVL2 599 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MYMKA6NI61 221 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 B4DLN1 442 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 HERVK_113P62684 666 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CDK17Q00537 523 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CEP112Q8N8E3 955 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EPC1Q9H2F5 836 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TBC1D8O95759 1140 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PICALMQ13492 652 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 HYIQ5T013 277 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RAB21Q9UL25 225 aa15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CTAGE9A4FU28 777 aa15.41■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FAM193AP78312 1265 aa15.41■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RAD54LQ92698 747 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms