RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 EXOC1Q9NV70 894 aa23.48■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 PSMD14O00487 310 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 RIMBP2O15034 1052 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 GTF2IP78347 998 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 PDE4DQ08499 809 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 AFF2P51816 1311 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 DDR1Q08345 913 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 STK4Q13043 487 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 PICALMQ13492 652 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 TRIM9Q9C026 710 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 SMCO2A6NFE2 343 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 RASSF10A6NK89 507 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 F8W031 263 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 SRGAP2O75044 1071 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 OR52Z1P0C646 297 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA1328Q86T90 577 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 P2RX5Q93086 422 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 FCER1AP12319 257 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 ASIC1P78348 528 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 MEA1Q16626 185 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 VPS18Q9P253 973 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS2-201ENST00000308020 CCNE1P24864 410 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 CASP8Q14790 479 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 SLF2Q8IX21 1173 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 RCCD1A6NED2 376 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.342e-7■■■■□ 20.8
PTDSS2-201ENST00000308020 TECP42680 631 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 HPS3Q969F9 1004 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 AK8Q96MA6 479 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 PIGSQ96S52 555 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 CUEDC2Q9H467 287 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 USP17L5A8MUK1 530 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 LMAN1P49257 510 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 KRT83P78385 493 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 22.3
PTDSS2-201ENST00000308020 EXOC4Q96A65 974 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 MMS19Q96T76 1030 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 GBP3Q9H0R5 595 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 GAKO14976 1311 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 C6orf50Q9HD87 102 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 BICDL2A1A5D9 508 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 SEMA3FQ13275 785 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 MYH1P12882 1939 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 KRT86O43790 486 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 GNA11P29992 359 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 MIIPQ5JXC2 388 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 SOGA3Q5TF21 947 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 NUP58Q9BVL2 599 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBED6P86452 979 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP27A1Q02318 531 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR93Q6P2C0 686 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 NEK8Q86SG6 692 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTDSS2-201ENST00000308020 TRIM37O94972 964 aa23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms