RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 PHOX2BQ99453 314 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 ACEP12821 1306 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 CCDC151A5D8V7 595 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 K7ENM7 598 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 STXBP3O00186 592 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 MAP2K7O14733 419 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 PFKFB2O60825 505 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 RASGRP1O95267 797 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 AGR2O95994 175 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 NLRP12P59046 1061 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 ST5P78524 1137 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 PURAQ00577 322 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 PICALMQ13492 652 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 PLBD1Q6P4A8 553 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 RTL10Q7L3V2 364 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 DGKHQ86XP1 1220 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 FAM81BQ96LP2 452 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 IFNKQ9P0W0 207 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 PARP3Q9Y6F1 533 aa10.16□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 FLT4P35916 1363 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 KCNQ2O43526 872 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 URI1O94763 535 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 SMC2O95347 1197 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 EVCP57679 992 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 KRT83P78385 493 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 PPP2R5CQ13362 524 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 FSIP1Q8NA03 581 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 LRRN4CLQ8ND94 238 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 MAML1Q92585 1016 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 CEP95Q96GE4 821 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 SDF4Q9BRK5 362 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 CARD6Q9BX69 1037 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 FUT8Q9BYC5 575 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 TRPV5Q9NQA5 729 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 CYLDQ9NQC7 956 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 RTEL1Q9NZ71 1219 aa10.15□□□□□ -0.78
MMP3-201ENST00000299855 RFX7Q2KHR2 1363 aa10.15□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 POTEB2H3BUK9 544 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ARHGAP6O43182 974 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 AKAP10O43572 662 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TAF5LO75529 589 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SASH3O75995 380 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 CLDN10P78369 228 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TUBB2AQ13885 445 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 FAM227BQ96M60 508 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TUBB2BQ9BVA1 445 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 IRAK4Q9NWZ3 460 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 NRAPQ86VF7 1730 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 C9IYK1 514 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 JAK2O60674 1132 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TUBBP07437 444 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 GJA8P48165 433 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 RENBPP51606 427 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PLIN5Q00G26 463 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SLC7A5Q01650 507 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 LEKR1Q6ZMV7 388 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 DDX11Q96FC9 970 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 USP28Q96RU2 1077 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 BTG4Q9NY30 223 aa10.14□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 A0A1B0GUL7 405 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MAGEA9P43362 315 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ME1P48163 572 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 RXRGP48443 463 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 BCAMP50895 628 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 KRT72Q14CN4 511 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 NCAPHQ15003 741 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 Q6ZUG5 572 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TRIM22Q8IYM9 498 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 KCT2Q8NC54 265 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms