RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298260.8

SKA3-201, Transcript of spindle and kinetochore associated complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene SKA3, Length 2,803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA3-201ENST00000298260 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TRIM58Q8NG06 486 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MDM1Q8TC05 714 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TCP11Q8WWU5 503 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MBD4O95243 580 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PAFAH1B1P43034 410 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PKN1Q16512 942 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ODF2Q5BJF6 829 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TTC38Q5R3I4 469 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 SPDL1Q96EA4 605 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 LIFRP42702 1097 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 CRYMQ14894 314 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ADSSL1Q8N142 457 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 GGT7Q9UJ14 662 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 GMNCA6NCL1 334 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 AKR1B10O60218 316 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ADAMTS2O95450 1211 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 KIF11P52732 1056 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PPP1R7Q15435 360 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 EXOC1Q9NV70 894 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 H7C1D1 291 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 CLTAP09496 248 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 SRGNP10124 158 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 KRT2P35908 639 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 FLT3P36888 993 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PHKA1P46020 1223 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 IFT20Q8IY31 132 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 NLRP3Q96P20 1036 aa14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ZBED6P86452 979 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 METTL24Q5JXM2 366 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 HVCN1Q96D96 273 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MYH6P13533 1939 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 A0A1B0GUA9 196 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 RAD51CO43502 376 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 SLC1A4P43007 532 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 LRRC15Q8TF66 581 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 LPIN2Q92539 896 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 RAPGEF5Q92565 580 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 NOD2Q9HC29 1040 aa14.92□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 STAT6P42226 847 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 DNM2P50570 870 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 GDF3Q9NR23 364 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 A0A1W2PQC6 194 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ATP6V1G2O95670 118 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 KCNB1Q14721 858 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.91□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 FCER1AP12319 257 aa14.9□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SKA3-201ENST00000298260 HSD17B3P37058 310 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms