RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.25■■□□□ 1.47
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SNRNP25-201ENST00000293861 TDP2O95551 362 aa24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 TECP42680 631 aa24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 ECE1P42892 770 aa24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 PRELPP51888 382 aa24.24■■□□□ 1.47
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SNRNP25-201ENST00000293861 ARID5BQ14865 1188 aa24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.21■■□□□ 1.47
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SNRNP25-201ENST00000293861 CCZ1BP86790 482 aa24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25-201ENST00000293861 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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SNRNP25-201ENST00000293861 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.19■■□□□ 1.46
SNRNP25-201ENST00000293861 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.19■■□□□ 1.46
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SNRNP25-201ENST00000293861 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.18■■□□□ 1.46
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.18■■□□□ 1.46
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SNRNP25-201ENST00000293861 GRB10Q13322 594 aa24.18■■□□□ 1.46
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SNRNP25-201ENST00000293861 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SNRNP25-201ENST00000293861 PAK1Q13153 545 aa24.17■■□□□ 1.46
SNRNP25-201ENST00000293861 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.17■■□□□ 1.46
SNRNP25-201ENST00000293861 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.17■■□□□ 1.46
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SNRNP25-201ENST00000293861 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.17■■□□□ 1.46
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