RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274606.7

NHP2-201, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHP2, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-201ENST00000274606 ASTN1O14525 1302 aa14.59□□□□□ -0.07
NHP2-201ENST00000274606 CYTH3O43739 400 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PSMA5P28066 241 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 APOA5Q6Q788 366 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 KCNB2Q92953 911 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MTMR8Q96EF0 704 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 ALPK3Q96L96 1907 aa14.58□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 DNM1LO00429 736 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 ZBTB43O43298 467 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PGK1P00558 417 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 CFBP00751 764 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PDE4DQ08499 809 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 TRAF1Q13077 416 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.57□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 EVI5O60447 810 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RPS6KB1P23443 525 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 LRRC41Q15345 812 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RTN1Q16799 776 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 Q6ZUG5 572 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RNF180Q86T96 592 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 USP26Q9BXU7 913 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 VTA1Q9NP79 307 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.56□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 B4DLN1 442 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 APOBRQ0VD83 1088 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 FANCBQ8NB91 859 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RGS22Q8NE09 1264 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 DNERQ8NFT8 737 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 TBC1D5Q92609 795 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 BRF1Q92994 677 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 KATNBL1Q9H079 304 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SPC25Q9HBM1 224 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.55□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 OPLAHO14841 1288 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 ADCY6O43306 1168 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 COL6A1P12109 1028 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 TNFAIP2Q03169 654 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 COL20A1Q9P218 1284 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.54□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 POLR2MP0CAP2 368 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 SMARCA1P28370 1054 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 HSD17B4P51659 736 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 TLK2Q86UE8 772 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MORC4Q8TE76 937 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 FERMT2Q96AC1 680 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 RMDN3Q96TC7 470 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 MAF1Q9H063 256 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.53□□□□□ -0.08
NHP2-201ENST00000274606 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms