RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP2A1O14983 1001 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCRP11274 1271 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLRP5P59047 1200 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NR5A1Q13285 461 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPY5RQ15761 445 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C17orf99Q6UX52 265 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLIC4Q9Y696 253 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STXBP3O00186 592 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OAZ1P54368 228 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK38Q15208 465 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PORCNQ9H237 461 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GALNT17Q6IS24 598 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PGBD1Q96JS3 809 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAPAP54920 295 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNFRSF25Q93038 417 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFCC1Q9HA90 598 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF146Q9NTX7 359 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSKSQ9UJT2 592 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERCC3P19447 782 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NFIBO00712 420 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OPLAHO14841 1288 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTS3O15072 1205 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR78Q5VTH9 848 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BLIDQ8IZY5 108 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D5Q92609 795 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPTLC2O15270 562 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC39A14Q15043 492 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCB11O95342 1321 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ME1P48163 572 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPAQ15257 358 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BICD2Q8TD16 824 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WBP1LQ9NX94 342 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ESYT2A0FGR8 921 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMCO2A6NFE2 343 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCNA1P78396 465 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP6R2O75170 966 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC25A27O95847 323 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSMFQ6X4W1 530 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 JMYQ8N9B5 988 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACAD9Q9H845 621 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C6orf50Q9HD87 102 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0R2N6 131 aa23.2■■□□□ 1.3
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADALQ6DHV7 355 aa23.2■■□□□ 1.3
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNMA2Q9UL42 364 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PQ27 194 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PQ64 194 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PQD8 194 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LIG1P18858 919 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAPPC10P48553 1259 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF445P59923 1031 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAP1Q01518 475 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAF1Q13077 416 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE2SQ16763 222 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.19■■□□□ 1.3
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