RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 H7C1W4 665 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC63Q05C16 580 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 NEDD9Q14511 834 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 HAUS8Q9BT25 410 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 K7ENM7 598 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 H2AFZP0C0S5 128 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 NPR1P16066 1061 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KRT39Q6A163 491 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 H2AFVQ71UI9 128 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC25Q86WR0 208 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 DGKHQ86XP1 1220 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PHKBQ93100 1093 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MYL7Q01449 175 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PTH1RQ03431 593 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TTC39CQ8N584 583 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PLIN2Q99541 437 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CARD6Q9BX69 1037 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CFBP00751 764 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 INPP5BP32019 993 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SLFN14P0C7P3 912 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 RFX1P22670 979 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PTPREP23469 700 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GRAPQ13588 217 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 P2RX5Q93086 422 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 JAK2O60674 1132 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KYAT1Q16773 422 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 HESX1Q9UBX0 185 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MID2Q9UJV3 735 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFAB1O14561 156 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SCP2P22307 547 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 JAK3P52333 1124 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 HSPA2P54652 639 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SCRN1Q12765 414 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TPH2Q8IWU9 490 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CPA1P15085 419 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GTF2IP78347 998 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KRT81Q14533 505 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PROM2Q8N271 834 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 E9PCH4 1651 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KRT10P13645 584 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CDKL2Q92772 493 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 NT5C1BQ96P26 610 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 USP28Q96RU2 1077 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MMP14P50281 582 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 APOA5Q6Q788 366 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SARM1Q6SZW1 724 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MORC4Q8TE76 937 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 APBA3O96018 575 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TNNI1P19237 187 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PTK2Q05397 1052 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ADAM9Q13443 819 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 BBS5Q8N3I7 341 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TLDC2A0PJX2 215 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SLC12A2P55011 1212 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms