RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 LAMC1P11047 1609 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CAPN9O14815 690 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CHRNDQ07001 517 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 MYL10Q9BUA6 226 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 AMNQ9BXJ7 453 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 BIRC2Q13490 618 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 SLFN13Q68D06 897 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 THAP9Q9H5L6 903 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 SLAIN2Q9P270 581 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 THEGQ9P2T0 379 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 KLRF2D3W0D1 207 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 TTLL1O95922 423 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 SLC8A1P32418 973 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 TECP42680 631 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 GTF2IP78347 998 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CPXCR1Q8N123 301 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 NT5C1BQ96P26 610 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 APBA3O96018 575 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 RFX1P22670 979 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 PTK2Q05397 1052 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 KCNK3O14649 394 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 JAK2O60674 1132 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 H2AFZP0C0S5 128 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 BFSP1Q12934 665 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 H2AFVQ71UI9 128 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 MID2Q9UJV3 735 aa7.88□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 TCP10Q12799 353 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ADAM9Q13443 819 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 RPS6KA2Q15349 733 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 FAM160B2Q86V87 743 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 PBKQ96KB5 322 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 RILPQ96NA2 401 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 USP17L12C9JPN9 530 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 USP17L21D6R901 530 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 RNF8O76064 485 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ERVK-7P63135 1459 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 SEC24BO95487 1268 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ALAS1P13196 640 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 METTL13Q8N6R0 699 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 USP6P35125 1406 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 TTC1Q99614 292 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 MTMR6Q9Y217 621 aa7.87□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.86□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 A0A0D9SFI3 127 aa7.86□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP4P98171 946 aa7.86□□□□□ -1.15
CPS1-201ENST00000233072 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.86□□□□□ -1.15
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