RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640853.1

LPP-222, Transcript of LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPP, Length 18,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPP-222	ENST00000640853	PPARA	Q07869	468 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	WDR48	Q8TAF3	677 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	EYA3	Q99504	573 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853		Q9H521	79 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ATP5H	O75947	161 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	MAP7	Q14244	749 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	OR52Z1	P0C646	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	CCDC160	A6NGH7	325 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RASSF7	Q02833	373 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	BIRC3	Q13489	604 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TEC	P42680	631 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	PLA2G4A	P47712	749 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ZBED6	P86452	979 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	PICALM	Q13492	652 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RAB17	Q9H0T7	212 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	PTPRE	P23469	700 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TFAP4	Q01664	338 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SEMA3F	Q13275	785 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	NNT	Q13423	1086 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	PLS1	Q14651	629 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	C8orf74	Q6P047	294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TEX11	Q8IYF3	940 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	UIMC1	Q96RL1	719 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TBC1D8	O95759	1140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SERPING1	P05155	500 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	FAM212A	Q96EL1	285 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	EXOC3	O60645	756 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	BAG2	O95816	211 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	LIFR	P42702	1097 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SLC8A3	P57103	927 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	KRT71	Q3SY84	523 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	EPC1	Q9H2F5	836 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RAB20	Q9NX57	234 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	NPAT	Q14207	1427 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	KAT6A	Q92794	2004 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	BACH1	O14867	736 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ZBED4	O75132	1171 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	PDE6A	P16499	860 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	MFAP3	P55082	362 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	EMB	Q6PCB8	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	MB21D1	Q8N884	522 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	CLTA	P09496	248 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	CASP8	Q14790	479 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	PRR16	Q569H4	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	FAM117A	Q9C073	453 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TMEM232	C9JQI7	657 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	CTSW	P56202	376 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	IRX4	P78413	519 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	ALX1	Q15699	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	RUBCN	Q92622	972 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	KCNK3	O14649	394 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
LPP-222	ENST00000640853	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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