RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61	3e-6	■■■□□ 16.5
SPIN3-222	ENST00000639482	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	UFL1	O94874	794 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	LRP5	O75197	1615 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	PBX1	P40424	430 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	USP14	P54578	494 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	PKN1	Q16512	942 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT86	O43790	486 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	USP5	P45974	858 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	HERVK_113	P62684	666 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	ESYT3	A0FGR9	886 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	NCK2	O43639	380 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	UBA7	P41226	1012 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482		H0YHG0	523 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	IFT81	Q8WYA0	676 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	ATRN	O75882	1429 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	BUB1	O43683	1085 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MAGEA9	P43362	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	GNGT1	P63211	74 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	ARID5A	Q03989	594 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	SPAG1	Q07617	926 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA20	Q8TB22	786 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MED4	Q9NPJ6	270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MOCS3	O95396	460 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	APBA3	O96018	575 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	AMPD2	Q01433	879 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF5A	Q12840	1032 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC42	Q96M95	316 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-222	ENST00000639482	MNAT1	P51948	309 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	GRAP	Q13588	217 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	SPA17	Q15506	151 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	IL17A	Q16552	155 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC51	Q96ER9	411 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	AKR1B10	O60218	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	PDCL	Q13371	301 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	INF2	Q27J81	1249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-222	ENST00000639482	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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