RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636773.1

CACNB4-233, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-233	ENST00000636773	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	UBA7	P41226	1012 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC8A3	P57103	927 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	CETN1	Q12798	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	KCNB2	Q92953	911 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	STX6	O43752	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	BMP3	P12645	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	COG2	Q14746	738 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	PDHX	O00330	501 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	ZBTB43	O43298	467 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	RLBP1	P12271	317 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	NEK4	P51957	841 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	BFSP2	Q13515	415 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	RTN1	Q16799	776 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	G2E3	Q7L622	706 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CACNB4-233	ENST00000636773	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	ZAP70	P43403	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	PRMT2	P55345	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	ARPP19	P56211	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	NEDD9	Q14511	834 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	SYCE3	A1L190	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	AOC2	O75106	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	CAVIN2	O95810	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	PHKA1	P46020	1223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	MTMR2	Q13614	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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