RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 KIFC2Q96AC6 838 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN8-208ENST00000635751 ZNF165P49910 485 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 SNAP25P60880 206 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 FAM160B2Q86V87 743 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN8-208ENST00000635751 SPC24Q8NBT2 197 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.7■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 SLC39A14Q15043 492 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 TRIM5Q9C035 493 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 MMP1P03956 469 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.69■■□□□ 1.22
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