RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 EFCC1Q9HA90 598 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 WBP1LQ9NX94 342 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 SAGE1Q9NXZ1 904 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 VPS54Q9P1Q0 977 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 PNMA2Q9UL42 364 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCB11O95342 1321 aa17■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 STXBP3O00186 592 aa17■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC25A27O95847 323 aa17■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 TKFCQ3LXA3 575 aa17■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 BARHL2Q9NY43 387 aa17■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 GPR25O00155 361 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 NLRP5P59047 1200 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 GUCY1B3Q02153 619 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 SP3Q02447 781 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 NSMFQ6X4W1 530 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 ACAD9Q9H845 621 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF3AQ9Y496 699 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 RLFQ13129 1914 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.99■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 SMCO2A6NFE2 343 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 NFIBO00712 420 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 XBP1P17861 261 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 MAPK4P31152 587 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 COPB2P35606 906 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 TRIM29Q14134 588 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CHST13Q8NET6 341 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 C8orf76Q96K31 380 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 MROH8Q9H579 483 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 FBXO40Q9UH90 709 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.98■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CFBP00751 764 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 ADCY7P51828 1080 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF22Q14807 665 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 MCF2L2Q86YR7 1114 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 JMYQ8N9B5 988 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 TBC1D5Q92609 795 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 MMP19Q99542 508 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.97■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 FKTNO75072 461 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 FCER1AP12319 257 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 PSMC4P43686 418 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 KCTD2Q14681 263 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 GPR142Q7Z601 462 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 CUL5Q93034 780 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 SHISA4Q96DD7 197 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 C6orf50Q9HD87 102 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.96■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 H3BQV1 296 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 OPLAHO14841 1288 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 POLR2MP0CAP2 368 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 CALML3P27482 149 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 FCGRTP55899 365 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 UBE2SQ16763 222 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 IFFO2Q5TF58 517 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 KRT40Q6A162 431 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 PARP14Q460N5 1801 aa16.95■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 A0A0G2JMZ2 1700 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 PGK2P07205 417 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 CTGFP29279 349 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 GNA11P29992 359 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 TRIM47Q96LD4 638 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 ADAMTS3O15072 1205 aa16.93■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 FOXN1O15353 648 aa16.93■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 STRNO43815 780 aa16.93■□□□□ 0.3
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPREP23469 700 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms