RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607707.1

SNORD11B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11B, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11B-201ENST00000607707 EEF1DP3Q658K8 133 aa3.37□□□□□ -1.87
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SNORD11B-201ENST00000607707 NPLOC4Q8TAT6 608 aa3.37□□□□□ -1.87
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SNORD11B-201ENST00000607707 MAP4K2Q12851 820 aa3.34□□□□□ -1.87
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SNORD11B-201ENST00000607707 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD11B-201ENST00000607707 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD11B-201ENST00000607707 MLANAQ16655 118 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD11B-201ENST00000607707 ADGRF1Q5T601 910 aa3.34□□□□□ -1.87
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