RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596148.2

TRAPPC5-204, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 5,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-204ENST00000596148 CRCPO75575 148 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 USP17L3A6NCW0 530 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 USP17L4A6NCW7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 GMNNO75496 209 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 BPIFB4P59827 614 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 STK17AQ9UEE5 414 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 ADGRB3O60242 1522 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC89Q8N998 374 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 RAB20Q9NX57 234 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 ADAM9Q13443 819 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 UIMC1Q96RL1 719 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CLTCL1P53675 1640 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 RDH13Q8NBN7 331 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCND2P30279 289 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 RSPH3Q86UC2 560 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 HESX1Q9UBX0 185 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 HAUS1Q96CS2 278 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CARD6Q9BX69 1037 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 LCORLQ8N3X6 602 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CLRN2A0PK11 232 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 STAM2O75886 525 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 PSMC4P43686 418 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 SEPT2Q15019 361 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 GLI2P10070 1586 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 LIFRP42702 1097 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 STAT2P52630 851 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 RETREG2Q8NC44 543 aa22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC5-204ENST00000596148 IFNAR1P17181 557 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 MED10Q9BTT4 135 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 ALKQ9UM73 1620 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 SUSD4Q5VX71 490 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 P3H4Q92791 437 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 CLIC4Q9Y696 253 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 LRMPQ12912 555 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 DPP9Q86TI2 863 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 GIPC1O14908 333 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 TTLL6Q8N841 843 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 NARFQ9UHQ1 456 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 NACC1Q96RE7 527 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC5-204ENST00000596148 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms