RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 SRGNP10124 158 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TXNRD1Q16881 649 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TRIM9Q9C026 710 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 B4DLN1 442 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 LDHCP07864 332 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 LETM2Q2VYF4 491 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CPVLQ9H3G5 476 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CCNE1P24864 410 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 HDXQ7Z353 690 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 P2RX5Q93086 422 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 EXOC1Q9NV70 894 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 BICDL2A1A5D9 508 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 PSMD14O00487 310 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 HERVK_113P62684 666 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 PDE4DQ08499 809 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 MEA1Q16626 185 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ABCB6Q9NP58 842 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 MYH1P12882 1939 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 SBF2Q86WG5 1849 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ST5P78524 1137 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 GRAPQ13588 217 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 C6orf50Q9HD87 102 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 L1RE1Q9UN81 338 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 SMCO2A6NFE2 343 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 H3BQF6 201 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 GNA11P29992 359 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 VSNL1P62760 191 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NFIXQ14938 502 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 EYA3Q99504 573 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NUP58Q9BVL2 599 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TUBBP07437 444 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CDK8P49336 464 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ASIC1P78348 528 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 KRT83P78385 493 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 STK4Q13043 487 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 MCM6Q14566 821 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NEK8Q86SG6 692 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 RETREG2Q8NC44 543 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 SNED1Q8TER0 1413 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 RASSF10A6NK89 507 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 PPP1R2P41236 205 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 GBP3Q9H0R5 595 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 BTDP43251 543 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 GPS2Q13227 327 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 CERS3Q8IU89 383 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 FCER1AP12319 257 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TECP42680 631 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ZBED6P86452 979 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 AMPD3Q01432 767 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 SOGA3Q5TF21 947 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 TFR2Q9UP52 801 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-202ENST00000593586 ENC1O14682 589 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-202ENST00000593586 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-202ENST00000593586 KLK7P49862 253 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-202ENST00000593586 KIAA1328Q86T90 577 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-202ENST00000593586 NEK11Q8NG66 645 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-202ENST00000593586 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-202ENST00000593586 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-202ENST00000593586 KRT86O43790 486 aa22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms