RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589254.1

USP36-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 3

Gene USP36, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-215	ENST00000589254	GPR37L1	O60883	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	IGSF3	O75054	1194 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	MBD4	O95243	580 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	NKX3-2	P78367	333 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	TAP1	Q03518	808 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	USP17L21	D6R901	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	NDUFB10	O96000	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	SMPD1	P17405	629 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	GRB10	Q13322	594 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-215	ENST00000589254	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	NUCB1	Q02818	461 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254		F5H6K3	240 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	RASA1	P20936	1047 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	COPB2	P35606	906 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ADD2	P35612	726 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	MRE11	P49959	708 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	SNAP25	P60880	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	KLRC3	Q07444	240 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	HLA-C	Q95604	372 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	COG5	Q9UP83	839 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	SI	P14410	1827 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	IL9	P15248	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ZNF536	O15090	1300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	NHLH1	Q02575	133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	GPNMB	Q14956	572 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-215	ENST00000589254	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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