RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKCZQ05513 592 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE4BQ07343 736 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 GINM1Q9NU53 330 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ATAD5Q96QE3 1844 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 USP17L12C9JPN9 530 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 USP17L21D6R901 530 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-DOAP06340 250 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TPM2P07951 284 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PFKFB1P16118 471 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RESP18Q5W5W9 173 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa29.06■■■□□ 2.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 GRK4P32298 578 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 BACE1P56817 501 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRQQ9UN88 632 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 BMP15O95972 392 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 USP5P45974 858 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT2Q10981 343 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKS1AQ92625 1134 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTLC3Q9NUV7 552 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 GDF11O95390 407 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCB2Q00722 1185 aa29.04■■■□□ 2.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 MTFR1Q15390 333 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM34Q9BYJ4 488 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 EHD4Q9H223 541 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 BECN2A8MW95 431 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SYKP43405 635 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MTMR2Q13614 643 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 NUP133Q8WUM0 1156 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM5Q9C035 493 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 NLRP12P59046 1061 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.243e-8■■□□□ 13.7
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CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.01■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf81C9J6K1 198 aa29.01■■■□□ 2.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 FLT3LGP49771 235 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TMTC3Q6ZXV5 915 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MGAMO43451 1857 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 BTBD18B2RXH4 712 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 USP17L10C9JJH3 530 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NEMFO60524 1076 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPREP23469 700 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 GUCY1A2P33402 732 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SHC4Q6S5L8 630 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 DGKHQ86XP1 1220 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 BRMS1Q9HCU9 246 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MYH6P13533 1939 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SMTNL1A8MU46 457 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf60Q5U649 245 aa28.99■■■□□ 2.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 GH2P01242 217 aa28.98■■■□□ 2.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM13BQ9NYF5 915 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MYH1P12882 1939 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC34A2O95436 690 aa28.97■■■□□ 2.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 IKBKBO14920 756 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT2P35908 639 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1524Q8TCG1 905 aa28.96■■■□□ 2.23
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