RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.56■□□□□ 0.56
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.51■□□□□ 0.55
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TXKP42681 527 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJC18Q9H819 358 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STK17AQ9UEE5 414 aa18.51■□□□□ 0.55
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