RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	KATNBL1	Q9H079	304 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	MYADML2	A6NDP7	307 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	ADCY6	O43306	1168 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	NT5C2	P49902	561 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	GJA9	P57773	515 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	NEDD4	P46934	1319 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	TNFAIP2	Q03169	654 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	PNMA2	Q9UL42	364 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	ASGR1	P07306	291 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF543	Q08ER8	600 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	IQCA1	Q86XH1	822 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	TOX2	Q96NM4	488 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	ELP1	O95163	1332 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	DGKH	Q86XP1	1220 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	RAG1	P15918	1043 aa		33.45	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084		Q7L0L9	218 aa		33.45	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		33.45	■■■□□ 2.95
GPS1-225	ENST00000585084	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA0355	O15063	1070 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	KDM4A	O75164	1064 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	SNHG28	P0DPA3	235 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	SHH	Q15465	462 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	ASTN1	O14525	1302 aa		33.43	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		33.43	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	LAMA4	Q16363	1823 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	FAAP100	Q0VG06	881 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084		B4E1Z4	1266 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	NFIB	O00712	420 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	ITGB8	P26012	769 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	NKX3-2	P78367	333 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	TLK2	Q86UE8	772 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	KAT14	Q9H8E8	782 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	VTA1	Q9NP79	307 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	BEX3	Q00994	111 aa		33.4	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	PNMA1	Q8ND90	353 aa		33.4	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	KRT23	Q9C075	422 aa		33.4	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		33.4	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	CTAGE5	O15320	804 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	MORC4	Q8TE76	937 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GPS1-225	ENST00000585084	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ARVCF	O00192	962 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	SMPD1	P17405	629 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	CALML3	P27482	149 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	PDE4A	P27815	886 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	CDK7	P50613	346 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	TTC22	Q5TAA0	569 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ZEB2	O60315	1214 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	FPGS	Q05932	587 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ANKS1A	Q92625	1134 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084		Q9Y3F1	56 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	LCT	P09848	1927 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	CABYR	O75952	493 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93

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