RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	CNMD	O75829	334 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	ERVK-9	P63128	1117 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	ERVK-24	P63145	666 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	C17orf99	Q6UX52	265 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		19.37	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	STXBP3	O00186	592 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	CRHR2	Q13324	411 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM29	Q14134	588 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	GALNT17	Q6IS24	598 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	CHST13	Q8NET6	341 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	FBXO40	Q9UH90	709 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	ESYT2	A0FGR8	921 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	BCR	P11274	1271 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	CALML3	P27482	149 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	NAPA	P54920	295 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	PLS1	Q14651	629 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	COA7	Q96BR5	231 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	C8orf76	Q96K31	380 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	MROH8	Q9H579	483 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	RNF186	Q9NXI6	227 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	ALAS1	P13196	640 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	GNA11	P29992	359 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691		Q3C1V9	767 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	USH1G	Q495M9	461 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0G2JMZ2	1700 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TBCD-223	ENST00000576691	SLC4A3	P48751	1232 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	MCTP2	Q6DN12	878 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	BICD2	Q8TD16	824 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	AIFM3	Q96NN9	605 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	C6orf50	Q9HD87	102 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	CPA4	Q9UI42	421 aa		19.33	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	SMCO2	A6NFE2	343 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	DTNB	O60941	627 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	TRPA1	O75762	1119 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	MAPK4	P31152	587 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	NLRP5	P59047	1200 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	ACAD9	Q9H845	621 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	RNF146	Q9NTX7	359 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	RIPK3	Q9Y572	518 aa		19.32	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	MYH6	P13533	1939 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691		H3BQV1	296 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PIK3CD	O00329	1044 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	STRN	O43815	780 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	ERCC3	P19447	782 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	GHRHR	Q02643	423 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	KRT40	Q6A162	431 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	CUL5	Q93034	780 aa		19.31	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	MMP1	P03956	469 aa		19.3	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	SYT1	P21579	422 aa		19.3	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	ADCY7	P51828	1080 aa		19.3	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		19.3	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		19.3	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		19.3	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	19.3	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	TBC1D8	O95759	1140 aa		19.29	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	POLR2M	P0CAP2	368 aa		19.29	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		19.29	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PFAS	O15067	1338 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	OPLAH	O14841	1288 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	STX6	O43752	255 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PEX10	O60683	326 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	FCER1A	P12319	257 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	RGS19	P49795	217 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	HSD17B4	P51659	736 aa		19.28	■□□□□ 0.68

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