RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562664.5

PPP4C-204, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-204	ENST00000562664	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	FAM227B	Q96M60	508 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	ZMYM6	O95789	1325 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	ARVCF	O00192	962 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	BEX3	Q00994	111 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	TNFAIP2	Q03169	654 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	DCAF4	Q8WV16	495 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	MTMR7	Q9Y216	660 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	CCDC96	Q2M329	555 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	FGA	P02671	866 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	ICAM1	P05362	532 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	TLK2	Q86UE8	772 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	MYLIP	Q8WY64	445 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07	2e-6	■■■■□ 20.1
PPP4C-204	ENST00000562664	GBF1	Q92538	1859 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	PTGS1	P23219	599 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	TICAM2	Q86XR7	235 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-204	ENST00000562664	CD4	P01730	458 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	SMPD1	P17405	629 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	MORC4	Q8TE76	937 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TOMM22	Q9NS69	142 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC16A2	P36021	539 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06	1e-6	■□□□□ 10.8
PPP4C-204	ENST00000562664	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	NSMF	Q6X4W1	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	CSF2RA	P15509	400 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	DNAJB2	P25686	324 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	RASIP1	Q5U651	963 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	VTA1	Q9NP79	307 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	NFIB	O00712	420 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	CABYR	O75952	493 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	PDHB	P11177	359 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	HAND2	P61296	217 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	LNPK	Q9C0E8	428 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664		Q9Y3F1	56 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	FOSL2	P15408	326 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	MYH6	P13533	1939 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-204	ENST00000562664	VCAN	P13611	3396 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	SNHG28	P0DPA3	235 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	CYP2C18	P33260	490 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	ZNF543	Q08ER8	600 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	ITGA7	Q13683	1181 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	SMC5	Q8IY18	1101 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-204	ENST00000562664	ACR	P10323	421 aa		27.87	■■■□□ 2.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms