RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 GLB1P16278 677 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 GRIA4P48058 902 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NLRP12P59046 1061 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 GPSM2P81274 684 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 SLFN5Q08AF3 891 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 GRAPQ13588 217 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 HGSNATQ68CP4 663 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 CSRNP1Q96S65 589 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 BCL11AQ9H165 835 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 GREM2Q9H772 168 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NAV1Q8NEY1 1877 aa5.4□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 A0A096LPE4 126 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PPZ6 126 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SHTN1A0MZ66 631 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SNAP23O00161 211 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PLIN1O60240 522 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 RAD17O75943 681 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 KLRK1P26718 216 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ALDH1B1P30837 517 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 GCKRQ14397 625 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 DUOXA2Q1HG44 320 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 NIM1KQ8IY84 436 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 RGS22Q8NE09 1264 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 EHD4Q9H223 541 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ABCB6Q9NP58 842 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 JAG2Q9Y219 1238 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 MYH1P12882 1939 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 LAMB1P07942 1786 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PDE8AO60658 829 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 BCAR3O75815 825 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ITPKAP23677 461 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ARL4DP49703 201 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 C1QTNF8P60827 252 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PCDH1Q08174 1060 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 GRM2Q14416 872 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 DSC3Q14574 896 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SOGA3Q5TF21 947 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SUCLG2Q96I99 432 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 CEP41Q9BYV8 373 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF576Q9H609 170 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 YDJCA8MPS7 323 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 GRM8O00222 908 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ECE2O60344 883 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 TAF5LO75529 589 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 B3GALT4O96024 378 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 KCNJ4P48050 445 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 GRM1Q13255 1194 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 UVSSAQ2YD98 709 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 BEND3Q5T5X7 828 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 LINS1Q8NG48 757 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 JDP2Q8WYK2 163 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 ASB16Q96NS5 453 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 MXD3Q9BW11 206 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 USP26Q9BXU7 913 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms