RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557265.5

SNX6-209, Transcript of sorting nexin 6, humanhuman

TSL 3

Gene SNX6, Length 725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6-209ENST00000557265 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX6-209ENST00000557265 IL27Q8NEV9 243 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX6-209ENST00000557265 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX6-209ENST00000557265 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX6-209ENST00000557265 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX6-209ENST00000557265 RNF146Q9NTX7 359 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX6-209ENST00000557265 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX6-209ENST00000557265 ZNF536O15090 1300 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX6-209ENST00000557265 ZEB2O60315 1214 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 TSPY8P0CW00 308 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 PSMC6P62333 389 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 MYH8P13535 1937 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 FAM160B2Q86V87 743 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.62□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 TFF2Q03403 129 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 NSMFQ6X4W1 530 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 TTLL4Q14679 1199 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-209ENST00000557265 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SNX6-209ENST00000557265 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX6-209ENST00000557265 INCENPQ9NQS7 918 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-209ENST00000557265 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX6-209ENST00000557265 TSPY2A6NKD2 308 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX6-209ENST00000557265 NMT2O60551 498 aa14.57□□□□□ -0.08
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