RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
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PTPRB-208ENST00000550358 ATP11AP98196 1134 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 SLC39A14Q15043 492 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 H7C1W4 665 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 PRDM1O75626 825 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 FGAP02671 866 aa9.33□□□□□ -0.92
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