RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 HID1Q8IV36 788 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 TRPM2O94759 1503 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1B0GTL3 188 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 CNR2P34972 360 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 CDSNQ15517 529 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 SPATA25Q9BR10 227 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 ABLIM1O14639 778 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 ENC1O14682 589 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 NOBOXO60393 691 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 NWD1Q149M9 1564 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 USP40Q9NVE5 1235 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 JCADQ9P266 1359 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 FZD7O75084 574 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 PNLIPP16233 465 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 NCKAP1LP55160 1127 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM129BQ96TA1 746 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF747Q9BV97 191 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 LNPKQ9C0E8 428 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRQ-204ENST00000549355 PTCH1Q13635 1447 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 KLF10Q13118 480 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 LIMS1P48059 325 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 E9PCH4 1651 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SH3D21A4FU49 640 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SSFA2P28290 1259 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 ETV3P41162 512 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 CDK8P49336 464 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 TMC6Q7Z403 805 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 METP08581 1390 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCC11Q96J66 1382 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 HTRA3P83110 453 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 PI16Q6UXB8 463 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 BRINP3Q76B58 766 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 HDXQ7Z353 690 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 LOXL4Q96JB6 756 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 RGL3Q3MIN7 710 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 BCO2Q9BYV7 579 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 TECPR2O15040 1411 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRQ-204ENST00000549355 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms