RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 PIBF1Q8WXW3 757 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 BRF1Q92994 677 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MAML3Q96JK9 1138 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PIGSQ96S52 555 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 FBXO40Q9UH90 709 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 IGHA2P01877 340 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 FGD1P98174 961 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CNTN2Q02246 1040 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TKFCQ3LXA3 575 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 IFFO2Q5TF58 517 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 NSMFQ6X4W1 530 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TMTC2Q8N394 836 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 MTMR8Q96EF0 704 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 DDX11Q96FC9 970 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 MAP3K14Q99558 947 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 AGXT2Q9BYV1 514 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RIOX1Q9H6W3 641 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ASTN1O14525 1302 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 DNAH12Q6ZR08 3092 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 GOLGA8AA7E2F4 631 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 GOLGA8BA8MQT2 603 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ZBTB5O15062 677 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ZBTB43O43298 467 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CALM1P0DP23 149 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CALM2P0DP24 149 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CALM3P0DP25 149 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CDC27P30260 824 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 KIF5BP33176 963 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RTN1Q16799 776 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 FBXO11Q86XK2 927 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 FANCBQ8NB91 859 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TRPV1Q8NER1 839 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TBC1D5Q92609 795 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SHISA4Q96DD7 197 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SPZ1Q9BXG8 430 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RNF208Q9H0X6 261 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PFASO15067 1338 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ABCB11O95342 1321 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 NID2Q14112 1375 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SOWAHBA6NEL2 793 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 POTEB2H3BUK9 544 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 OPLAHO14841 1288 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CYBAP13498 195 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CALML3P27482 149 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.816e-6■■■□□ 15.4
CS-211ENST00000548041 ANAPC15P60006 121 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 MFSD14CQ5VZR4 134 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 FAM133AQ8N9E0 248 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 DEFB118Q96PH6 123 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SLC5A4Q9NY91 659 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RPTORQ8N122 1335 aa10□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PPFIA3O75145 1194 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ANO1Q5XXA6 986 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 FBXL16Q8N461 479 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 IL17RAQ96F46 866 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TINF2Q9BSI4 451 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 AMNQ9BXJ7 453 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms