RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	DEFB103A	P81534	67 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298		Q9Y3F1	56 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PRKAB2	O43741	272 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ZEB2	O60315	1214 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	GNAI2	P04899	355 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	IRS1	P35568	1242 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PDE6A	P16499	860 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TECTA	O75443	2155 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298		F5H6K3	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	RAD21	O60216	631 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	GJB5	O95377	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	NDUFB10	O96000	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	PTPN5	P54829	565 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	KLRC3	Q07444	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ASB14	A6NK59	587 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	GFRA3	O60609	400 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ZBED4	O75132	1171 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	RAD9A	Q99638	391 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	USP17L21	D6R901	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	KCNJ6	P48051	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	OAZ1	P54368	228 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TRIO	O75962	3097 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	SI	P14410	1827 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MYH8	P13535	1937 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	BCAR3	O75815	825 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	LTBR	P36941	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	EDA	Q92838	391 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms