RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546211.5

SKP2-208, Transcript of S-phase kinase associated protein 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SKP2, Length 1,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2-208ENST00000546211 TBCKQ8TEA7 893 aa22.16■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 FERMT2Q96AC1 680 aa22.16■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 CLIC6Q96NY7 704 aa22.16■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.16■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.16■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 KINO60870 393 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 FLOT1O75955 427 aa22.15■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 HMGCS2P54868 508 aa22.15■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.15■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.14■■□□□ 1.14
SKP2-208ENST00000546211 LETM2Q2VYF4 491 aa22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 RESP18Q5W5W9 173 aa22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SHC4Q6S5L8 630 aa22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.14■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 PFKFB1P16118 471 aa22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 NDUFA8P51970 172 aa22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 MAP3K11Q16584 847 aa22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 TNMDQ9H2S6 317 aa22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L15C9J2P7 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L11C9JVI0 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L18D6R9N7 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L22D6RA61 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L19D6RCP7 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L20D6RJB6 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 FDX1P10109 184 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L24Q0WX57 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 AP3B2Q13367 1082 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 RRAGCQ9HB90 399 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ABCB11O95342 1321 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 OTOFQ9HC10 1997 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 LAD1O00515 517 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 LDHDQ86WU2 507 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ELP3Q9H9T3 547 aa22.12■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 MEIS2O14770 477 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ZBED4O75132 1171 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ICAM1P05362 532 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 POTEIP0CG38 1075 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 POTEJP0CG39 1038 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 PPATQ06203 517 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CAMK4Q16566 473 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CSRNP2Q9H175 543 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 PNMA2Q9UL42 364 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 HPSEQ9Y251 543 aa22.11■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CTAGE5O15320 804 aa22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SYKP43405 635 aa22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 GRIN1Q05586 938 aa22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ERO1BQ86YB8 467 aa22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ANO3Q9BYT9 981 aa22.1■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.09■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.09■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 PIK3CDO00329 1044 aa22.09■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 NEMFO60524 1076 aa22.09■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 MOB2Q70IA6 237 aa22.09■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ZNF536O15090 1300 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 OPLAHO14841 1288 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 ZNF202O95125 648 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 PRPHP41219 470 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 SPECC1Q5M775 1068 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.08■■□□□ 1.13
SKP2-208ENST00000546211 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SKP2-208ENST00000546211 POLR2MP0CAP2 368 aa22.08■■□□□ 1.12
SKP2-208ENST00000546211 COG2Q14746 738 aa22.08■■□□□ 1.12
SKP2-208ENST00000546211 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.08■■□□□ 1.12
SKP2-208ENST00000546211 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.08■■□□□ 1.12
SKP2-208ENST00000546211 OTUD5Q96G74 571 aa22.08■■□□□ 1.12
SKP2-208ENST00000546211 FSD2A1L4K1 749 aa22.07■■□□□ 1.12
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