RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532612.5

BCO2-215, Transcript of beta-carotene oxygenase 2, human

TSL 1 (best)

Gene BCO2, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCO2-215	ENST00000532612	FLT3LG	P49771	235 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	PHKB	Q93100	1093 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	FCER1A	P12319	257 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	HOXD10	P28358	340 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	COPB2	P35606	906 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	EVC	P57679	992 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SCRN1	Q12765	414 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	GRB14	Q14449	540 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	KCTD2	Q14681	263 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ME3	Q16798	604 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ABCB11	O95342	1321 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.05	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CPLX1	O14810	134 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ST18	O60284	1047 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ELN	P15502	786 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	RCAN1	P53805	252 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	MORN1	Q5T089	497 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.04	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	PFKFB2	O60825	505 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	COBL	O75128	1261 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	GNRH1	P01148	92 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CALML3	P27482	149 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	RGS2	P41220	211 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	FUT2	Q10981	343 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CCL14	Q16627	93 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	CENPF	P49454	3210 aa		13.03	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.02	□□□□□ -0.32
BCO2-215	ENST00000532612	ADCY3	O60266	1144 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	CFB	P00751	764 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	FOSB	P53539	338 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	NTRK3	Q16288	839 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	TRIB2	Q92519	343 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	APBA2	Q99767	749 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	STRN	O43815	780 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	IFNAR1	P17181	557 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	NAPA	P54920	295 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	PRMT2	P55345	433 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	TRIM32	Q13049	653 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
BCO2-215	ENST00000532612	USP6NL	Q92738	828 aa		13.01	□□□□□ -0.33

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